Go Back   Diễn đàn Sinh học Việt Nam > Giảng đường > Di truyền - Sinh học phân tử

Di truyền - Sinh học phân tử Do hai bộ môn này khá gần nhau nên chúng được nhập chung vào một diễn đàn

Trả lời
 
Ðiều Chỉnh Xếp Bài
Old 24-05-17, 08:23   #1
TiNa
Registered Users
 
TiNa's Avatar
 
Tham gia ngày: May 2017
Đến từ: deagu, korea
Bài gửi: 3
Thanks: 2
Thanked 0 Times in 0 Posts
chào các anh/chị/bạn trong Group,
em là thành viên mới bước vào lĩnh vực sinh học phân tử-di truyền, mới 100%... nên em chưa có kinh nghiệm làm trong lĩnh vực này nên mong các anh/chị/bạn hướng dẫn thêm cho em ạ.
vấn đề của em là, trong 1 loài chưa được giải mã hoàn toàn bộ gene, em muốn tìm 1 gene mới(novel gene) thì nên bắt đầu như thế nào ạ?
TiNa is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn

Sponsored Links
Old 28-05-17, 00:09   #2
Nguyễn Ngọc Lương
Administrator
 
Nguyễn Ngọc Lương's Avatar
 
Tham gia ngày: Nov 2005
Đến từ: Đại học Huế
Bài gửi: 2,143
Thanks: 157
Thanked 716 Times in 424 Posts
Nothing in biology makes sense except in the light of evolution.
Tất cả các loài đều chung một nguồn gốc. Tất cả các gene đều có cùng một tổ tiên.
Gene có thể thay đổi nhưng protein thì ít thay đổi hơn.
__________________
Molecular biology is deceptively simple.
Method is everything but the devil is in the detail
Molecular biology and religion have one thing in common: you must have faith in what you can not see
Nguyễn Ngọc Lương is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Thanked by
Old 29-05-17, 13:34   #3
TiNa
Registered Users
Thread starter
 
TiNa's Avatar
 
Tham gia ngày: May 2017
Đến từ: deagu, korea
Bài gửi: 3
Thanks: 2
Thanked 0 Times in 0 Posts
em vẫn chưa hiểu rõ ý của anh ạ, mong anh giải thích thêm.
TiNa is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Old 22-06-17, 15:55   #4
Minh đức
Registered Users
 
Minh đức's Avatar
 
Tham gia ngày: Jun 2017
Bài gửi: 1
Thanks: 0
Thanked 0 Times in 0 Posts
thấy Lương có thể nói qua cho em biết về kĩ thuật mini-prep và one step được không ạ ,ưu nhược điểm của nó luôn
cảm ơn thầy nhiều
Minh đức is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Old 07-08-17, 13:35   #5
ducfabulous
Registered Users
 
ducfabulous's Avatar
 
Tham gia ngày: Aug 2017
Bài gửi: 2
Thanks: 0
Thanked 0 Times in 0 Posts
bạn giải trình tự bộ gene của loài đó ra rồi đem blast tìm ra các đoạn gene mới.
ducfabulous is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Old 28-08-17, 15:13   #6
Kimuvo
Thành viên
 
Kimuvo's Avatar
 
Tham gia ngày: Nov 2011
Bài gửi: 19
Thanks: 0
Thanked 5 Times in 2 Posts
Trích:
Nguyên văn bởi TiNa View Post
chào các anh/chị/bạn trong Group,
em là thành viên mới bước vào lĩnh vực sinh học phân tử-di truyền, mới 100%... nên em chưa có kinh nghiệm làm trong lĩnh vực này nên mong các anh/chị/bạn hướng dẫn thêm cho em ạ.
vấn đề của em là, trong 1 loài chưa được giải mã hoàn toàn bộ gene, em muốn tìm 1 gene mới(novel gene) thì nên bắt đầu như thế nào ạ?
1. Để tìm một gen mới chưa biết ở một loài nào đó thì ít nhất bạn cũng phải biết loại gen đó có chức năng gì, có cơ sở dữ liệu về gen/protein tương đồng ở những loài khác hay không? Bạn không thể tìm một gen mới hoàn toàn nếu như bạn không hề có chút thông tin nào về nó.
2. Nếu đã có thông tin thì bạn cần tìm dữ liệu về trình tự protein của gen đó ở loài khác. Ví dụ bạn muốn biết trình tự gen NHX ở lúa (giả sử gen này chưa được công bố kết quả giải trình tự ở lúa) thì bạn cần tìm dữ liệu về các antiporter Na+/H+ ở thực vật, gần hơn nữa bạn tìm họ gen NHX ở Arabidopsis, Maize, Glycine max...Cơ sở dữ liệu chung được nhắc đến đầu tiên là NCBI, chuyên khảo hơn ở thực vật là phytozome database.
a) Lựa chọn cơ sở dữ liệu và tìm kiếm gen/protein tương đồng:
Bạn cần biết tên gen hoặc họ gen đó là gì, ví dụ họ NHX bạn truy ra tên locus của nó trên database.
Từ đó bạn cần quan tâm là trình tự amino acid trên database. Cái trình tự này rất quan trọng vì bạn sẽ phải thiết kế mồi suy biến dựa trên trình tự protein tương đồng này để thu được trình tự mồi mình cần. Có mồi => PCR => giải trình tự gen=> Dùng phần mềm translate nó sang protein.

b) Truy tìm gen mới:
Từ kết quả giải trình tự quay lại bạn blast với cơ sở dữ liệu và đây mới là vấn đề
Bạn cần phải blast kết quả giải trình tự với 2 cơ sở dữ liệu:
thứ nhất với trình tự protein/họ protein tương đồng (ở loài mà ban đầu bạn lấy trình tự protein của nó để thiết kế mồi) để so sánh xem mức độ khác nhau như thế nào? Nếu sai khác quá nhiều cần xem lại kết quả thí nghiệm.
Thứ 2 Blast kết quả giải trình tự với trình tự genome mà bạn quan tâm để biết vị trí gen mới của bạn nằm trên NST nào vị trí ra sao. Xem có giống với gen nào khác đã được xác định trước đó hay không?
Bước này cũng cần phải so sánh với trình tự protein nữa.
Thực tế thì tìm kiếm một gen hoàn toàn mới ít phổ biến hơn. Đa số họ toàn giải trình tự của một gen nào đó dựa trên trình tự gen tương đồng cùng loài hoặc khác loài.
Kimuvo is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Old 28-08-17, 16:16   #7
TiNa
Registered Users
Thread starter
 
TiNa's Avatar
 
Tham gia ngày: May 2017
Đến từ: deagu, korea
Bài gửi: 3
Thanks: 2
Thanked 0 Times in 0 Posts
Em cam on moi nguoi ak.
e da lam nhu tren nhung ket qua k tot nen dang lam lai.
mong tim dc cai gi do hay ho de may mo :3
p/s: may tinh e k go tieng viet duoc, rat xin loi moi nguoi ak :'(
TiNa is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Trả lời

Ðiều Chỉnh
Xếp Bài

Chuyển đến

Similar Threads
Ðề tài Người gửi Chuyên mục Trả lời Bài mới gởi
Liên kết Gene và ứng dụng vantaidh10sh Lớp 12: Di truyền - Biến dị 0 05-01-11 12:57
Tìm ra bản đồ gene của bệnh ung thư Lê Đức Dũng Di truyền - Sinh học phân tử 0 07-11-08 23:09
Sự tương đồng giữa mô hình biểu hiện gene với định luật Ohm Cao Xuân Hiếu Thảo luận chung 2 25-04-06 21:38
Gene gây bệnh ! Đào Anh Phúc Di truyền - Sinh học phân tử 0 10-03-06 18:49
Chỉ định gene - Lấp lỗ hổng bộ gene giun tròn. Dương Văn Cường Di truyền - Sinh học phân tử 15 06-06-05 18:14


vB 3.8.7 Copyright © 2000 - 2017, Jelsoft Enterprises Ltd.