Go Back   Diễn đàn Sinh học Việt Nam > Giảng đường > Tin sinh học

Tin sinh học Một bộ môn mới đầy triển vọng

 
Trả lời
 
Ðiều Chỉnh Xếp Bài
Old 18-05-10, 08:48   #1
Ho Huu Tho
Thành viên
 
Ho Huu Tho's Avatar
 
Tham gia ngày: Feb 2010
Đến từ: Helsinki, Finland
Bài gửi: 1,712
Thanks: 693
Thanked 551 Times in 383 Posts
Tôi có đọc được bài giới thiệu về phần mềm thống kê R tại website mới của thầy Nguyễn Văn Tuấn ở đây. Tôi thấy rất hấp dẫn và muốn hỏi kinh nghiệm thực tế của các bạn đã từng sử dụng nó để có định hướng học về nó. Vậy nếu có bạn nào đã từng sử dụng thì làm ơn chia sẻ với mình đôi điều ở đây nhé.
Ho Huu Tho is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn

Sponsored Links
Old 18-05-10, 13:46   #2
Nguyễn Ngọc Lương
Administrator
 
Nguyễn Ngọc Lương's Avatar
 
Tham gia ngày: Nov 2005
Đến từ: Đại học Huế
Bài gửi: 2,143
Thanks: 157
Thanked 716 Times in 424 Posts
Đúng là mình cũng thuộc nhóm lười. Cứ thấy dùng lệnh là bực cả mình rồi...
__________________
Molecular biology is deceptively simple.
Method is everything but the devil is in the detail
Molecular biology and religion have one thing in common: you must have faith in what you can not see
Nguyễn Ngọc Lương is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Thanked by
Old 20-12-10, 15:35   #3
cnvs
Registered Users
 
cnvs's Avatar
 
Tham gia ngày: Dec 2010
Bài gửi: 3
Thanks: 2
Thanked 2 Times in 2 Posts
Nếu không thích dùng lệnh thì có thể sử dụng giao diện với R.

Mình nghĩ R rất hữu dụng vì mình có thể làm theo ý mình.
cnvs is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Thanked by
Old 20-12-10, 17:05   #4
Nguoi nhai
Thành viên
 
Nguoi nhai's Avatar
 
Tham gia ngày: Dec 2008
Bài gửi: 146
Thanks: 42
Thanked 77 Times in 61 Posts
Trích:
Nguyên văn bởi cnvs View Post
Nếu không thích dùng lệnh thì có thể sử dụng giao diện với R.

Mình nghĩ R rất hữu dụng vì mình có thể làm theo ý mình.
Mình cũng nghĩ vậy vì R có nhiều ứng dụng lắm mặc khác là download miễn phí mà k lo ngại và vấn đề bản quyền, tôi thích dùng R để vẽ đồ thị và chạy thống kê.
Tôi đang mài mò cách sữ dụng R để tạo cluster và chạy PCA. Anh chị em nào rành cái này có thể chia sẻ kinh nghiệm nhé.
Nguoi nhai is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Thanked by
Old 21-12-10, 12:12   #5
cnvs
Registered Users
 
cnvs's Avatar
 
Tham gia ngày: Dec 2010
Bài gửi: 3
Thanks: 2
Thanked 2 Times in 2 Posts
Trích:
Nguyên văn bởi Nguoi nhai View Post
Mình cũng nghĩ vậy vì R có nhiều ứng dụng lắm mặc khác là download miễn phí mà k lo ngại và vấn đề bản quyền, tôi thích dùng R để vẽ đồ thị và chạy thống kê.
Tôi đang mài mò cách sữ dụng R để tạo cluster và chạy PCA. Anh chị em nào rành cái này có thể chia sẻ kinh nghiệm nhé.
Trong năm tới mình cũng sẽ đụng đến vấn đề của bác. Hi vọng sẽ liên lạc và học hỏi từ bác. Lúc trước mình có viết các modun nhỏ dạng linear or generalized linear models cho 1 package của thầy mình.
cnvs is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Thanked by
Old 21-12-10, 14:38   #6
Nguoi nhai
Thành viên
 
Nguoi nhai's Avatar
 
Tham gia ngày: Dec 2008
Bài gửi: 146
Thanks: 42
Thanked 77 Times in 61 Posts
Trích:
Nguyên văn bởi cnvs View Post
Trong năm tới mình cũng sẽ đụng đến vấn đề của bác. Hi vọng sẽ liên lạc và học hỏi từ bác. Lúc trước mình có viết các modun nhỏ dạng linear or generalized linear models cho 1 package của thầy mình.
Sẵn sàng thôi, nhưng mình cũng đang mày mò dò dẫm từ từ nè, rất khó để viết các câu lệnh như vậy mà tham khảo sách viết vẫn không đủ. Sách của thầy Tuấn k có đề cập vấn đề này. Chờ xem diễn đàn chúng ta sẽ có chuyên gia về vấn đề này xuất hiện.Thanks.
Nguoi nhai is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Old 23-12-10, 01:54   #7
pththao
Thành viên
 
pththao's Avatar
 
Tham gia ngày: Apr 2010
Đến từ: Germany
Bài gửi: 257
Thanks: 165
Thanked 193 Times in 139 Posts
Chào mọi người, mình cũng đang hơi rắc rối với R. Mình đang viết chương trình clustering. Chương trình clustering built-in của R có sẵn một vài metric thông thường, nhưng không có cái mình cần "correlation." Có bạn nào biết gói thống kê cho phép người dùng định nghĩa metric xin chỉ giáo giùm :D
Viết một chương trình hoàn chỉnh không khó khăn gì nhưng tốc độ so với chương trình built-in giảm hẳn! Cái này dễ hiểu...
Thay đổi code của built-in function lại khá là khó khăn: đa số các chương trình kiểu thế được gọi từ một thư viện C hoặc Fortran, không thể can thiệp vào được.
pththao is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Thanked by
Old 23-12-10, 02:01   #8
pththao
Thành viên
 
pththao's Avatar
 
Tham gia ngày: Apr 2010
Đến từ: Germany
Bài gửi: 257
Thanks: 165
Thanked 193 Times in 139 Posts
Nhân tiện xem qua ở link bạn Hồ Hữu Thọ post, mình thấy một điểm khá quan trọng cho lập trình là dạng cấu trúc tổng quát của dữ liệu chưa được đề cập đến. Tác giả nhấn mạnh khía cạnh thực hành hơn. Mình học theo kiểu viết đến đâu tra... mạng đến đấy (may là R khá gần gũi với Matlab nên không khó khăn lắm) nên không nắm được chi tiết vấn đề này. Theo mình nếu bạn moi-vao-nghe nắm vững vấn đề này có thể viết một bài nhỏ giúp mọi người tham khảo, sẽ đặc biệt hữu ích cho người mới tiếp cận với R và có chút ít khái niệm về ngôn ngữ lập trình. Thanks :)
pththao is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Thanked by
Old 14-01-11, 22:42   #9
pththao
Thành viên
 
pththao's Avatar
 
Tham gia ngày: Apr 2010
Đến từ: Germany
Bài gửi: 257
Thanks: 165
Thanked 193 Times in 139 Posts
Tiếp tục thảo luận topic này chút đi :D
Mình không biết gì về object-oriented tuy nhiên có vẻ như R thuận tiện hơn nhiều ngôn ngữ khác, kể cả mathlab, ở chỗ coi tất cả các thứ sử dụng như là 'objects.'
Ấn tượng nhất là functions. Mình thấy functions trong R có thể coi như một objects, ở mức độ nào đó ngang hàng với một biến số thực, chẳng hạn x. Tức là nó có thuộc tính, có qui tắc tương tác với các objects khác. Như vậy lệnh f = function(x){} phải coi là một lệnh gán một đối tượng f cho một object kiểu function. Không biết cái này có phải ý tưởng chính của object-oriented không nhưng đúng là... rất thú vị. Chẳng hạn nhờ đó một function có thể trở thành một biến của function khác. Điều này hình như hoàn toàn không thực hiện được với pascal, thực hiện khó khăn với fortran 77 và 90, với matlab phải dùng cách khác lủng củng hơn (@-functions).
Bác nào có kinh nghiệm object-oriented xin giảng thêm :D
Tóm lại là mình bắt đầu thích R rồi :D
pththao is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Old 28-01-11, 00:00   #10
pththao
Thành viên
 
pththao's Avatar
 
Tham gia ngày: Apr 2010
Đến từ: Germany
Bài gửi: 257
Thanks: 165
Thanked 193 Times in 139 Posts
Hôm nay vui tay tìm thấy link này, mọi người có thể nghiên cứu thử,
http://www1.maths.lth.se/help/R/RCC/
Programing Style không quan trọng khi bắt đầu, nhưng quen một chút có lẽ không nên mắc phải những thói quen có hại :D
pththao is offline   Trả Lời Với Trích Dẫn
Thanked by
Trả lời

Ðiều Chỉnh
Xếp Bài

Chuyển đến


vB 3.8.7 Copyright © 2000 - 2017, Jelsoft Enterprises Ltd.